一般的な結論から申し上げますと、病名不明で何の客観的所見もないというような場合には、申請そのものが難しいと思います。
診断書にまず病名を書く欄がありますが、医師としてはまずそこから悩まれることでしょう。不明なので書けませんと。それでも無理に書いてもらってもそのうちボロが出てくると思います。（どうしてこの病名と診断したのか根拠を示せと年金機構から尋ねられ「いや、あの、その・・・そう書いてくれと言われたもんで」みたいな感じになってアウトでしょう。）
「病名が何であれ、ともかく今苦しんでいるんだから支給すべきだ」
という考え方を相談者から披露されたこともありますが、しかし、病名もなく他覚所見も得られない症状というのは審査側からすると「とどのつまりはそれって気のせいじゃないのですか？」と捉えられやすいだろうと思います。

という厳しい結論です。

当職としてはこの考えが厳しいというよりは、病名不明原因不明の傷病で困っているという実際の個別のご相談を細々と聞いていますと、余りにこれまでのその相談者さんの受診や治療行為への取り組み方が甘すぎやしないか、と思わざるをえないようなケースがほとんどであるという印象です。

大別すると以下のようなケースが挙げられます。
例えば
①何年も原因不明で困っていると言いながら病院は1件しか行ってない
②なぜかヤブ医者を気に入ってそこで長期間ああでもないこうでもないとやってる人
③何件もドクターショッピングしているけれども、個人医院かせいぜい中堅規模の病院くらいしか行っていない。
④ドクターショッピングしているけれども、ちょっとでも病院に気に入らないことがあると自己都合中断して、見切りが早すぎる人。
⑤そもそも医者の話を聞いていない人
⑥医師が付けた診断名を否定する

などなどの相談をお聞きしました。いずれも本当の意味での原因不明の症状と言えないのでは？という感想です。